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线粒体基因组论文有什么研究成果

分类:学术成果常识 时间:2022-04-01

  线粒体是真核细胞的一种细胞器,有它自己的基因组,这些基因组统称为线粒体基因组。经过漫长研究,如今线粒体基因组论文研究成果有很多,本文学术顾问给大家整理了一些分享给大家。

线粒体基因组论文有什么研究成果

  线粒体基因组论文一:小长蝽线粒体基因组全序列测定与长蝽总科系统发育分析

  摘要:为了了解小长蝽Nysius ericae(Schilling)线粒体基因组结构及长蝽总科的分子系统发育关系。本试验采用Illumina MiSeq测序平台对小长蝽线粒体基因进行测序,对基因组序列进行拼装、注释和特征分析,利用最大似然法和贝叶斯法构建基于12种长蝽总科昆虫线粒体全基因组核苷酸序列的系统发育树。小长蝽线粒体基因组全长为16 330 bp(GenBank 登录号:MW465654),基因组包括13个蛋白编码基因(PCGs),22个tRNA基因,2个rRNA基因和1段非编码控制区。11个蛋白质编码基因的起始密码子为典型的ATN;cox1,nad4l的起始密码子为TTG。cob的终止密码子为TAG,其余蛋白编码基因的终止密码子为TAA。只有trnS1缺少DHU臂,其余tRNA基因均能形成典型的三叶草结构。12种长蝽总科昆虫线粒体全基因组序列构建的昆虫系统发育树结果显示,小长蝽与Nysius plebeius具有更近的亲缘关系,且与传统形态学分类基本一致。小长蝽线粒体基因组符合长蝽总科线粒体基因组的一般特征。结果表明小长蝽与N. plebeius的亲缘关系更近。

  关键词:小长蝽;半翅目;背孔长蝽亚科;线粒体基因组;系统发育;

  线粒体基因组论文二:基于太平洋甲胁虱裂化线粒体基因组推测甲胁虱属祖先线粒体核型

  摘要:【目的】动物典型的单一染色体线粒体基因组在甲胁虱属Hoplopleura已裂化成多个线粒体微环染色体。本研究旨在通过测定太平洋甲胁虱Hoplopleura pacifica的线粒体基因组来推测甲胁虱属祖先线粒体核型。【方法】利用Illumina HiSeq X Ten高通量测序技术对太平洋甲胁虱裂化线粒体基因组进行测定,分析其结构特征与变异情况;用最大似然法和邻接法构建7科7属15种吸虱的系统发育树;用简约法推测甲胁虱属祖先线粒体核型。【结果】太平洋甲胁虱线粒体基因组测序获得29个基因(11个蛋白质编码基因,16个tRNA基因以及2个rRNA基因),且不均匀地分布于10个线粒体微环染色体上,每个线粒体微环染色体的编码区包括1~5个基因,大小在690~1 773 bp之间。甲胁虱属内物种线粒体微环染色体组成差异较小,与吸虱亚目(Anoplura)其他属相比,甲胁虱属线粒体微环染色体的基因组成和基因排列有差异,但这种差异仅限于tRNA基因。进化树强烈支持吸虱亚目分为两大进化支,一个大的进化支包括甲胁虱科(Hoplopleuridae)、多板虱科(Polyplacidae)、血虱科(Haematopinidae)和微胸虱科(Microthoraciidae),另一个大的进化支包括虱科(Pediculidae)、阴虱科(Pthiridae)和猴虱科(Pedicinidae)。甲胁虱属祖先线粒体核型由12个线粒体微环染色体组成,每个线粒体微环染色体由一个编码区和一个非编码区构成,编码区包含1~6个基因。【结论】本研究首次测定并分析了太平洋甲胁虱裂化线粒体基因组,并与迄今为止测序的另外2种甲胁虱的线粒体基因组进行了比较,推测出甲胁虱属祖先线粒体核型。 还原

  关键词:甲胁虱属;太平洋甲胁虱;线粒体基因组;线粒体微环染色体;线粒体核型;基因组裂化;

  线粒体基因组论文三:玉米线粒体基因组密码子偏好性分析

  摘要:为研究玉米(Zea mays)线粒体基因组的密码子偏好性,本研究以玉米亚种NB线粒体基因组为例,筛选出155条编码基因序列,通过生物信息学方法分析其密码子的使用模式。结果显示,玉米亚种NB线粒体基因组所编码基因密码子的GC含量与第一、第二和第三各位点的GC含量均小于50% (GC1, GC2, GC3),表明玉米亚种NB线粒体编码基因富含A和T碱基;有效密码子数(effective number of codons, Nc)与GC、GC1、GC2、GC3、GC3s均正相关;相对同义密码子使用频率(RSCU)>1的同义密码子共有29个,其中仅有3个以G/C结尾,表明密码子的第3位碱基使用偏好于A/T;中性绘图和Nc-plot分析发现选择压力可能是导致玉米线粒体基因组密码子使用模式之间差异的主要原因;最终通过高表达优越密码子方法确定了TTT、TTA、CTC等17个最优密码子,其中以A/T碱基结尾的最优密码子有12个。该研究结果有助于更好地了解玉米线粒体基因组密码子偏好性规律,为提高外源基因在线粒体中的表达效率提供了科学依据。

  关键词:玉米亚种NB;线粒体基因组;密码子偏好性;最优密码子;

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